隨著上杉家与朝廷先后对石山本愿寺方面施加压力，成功迫使石山御坊开城，以及现任一向宗法主本愿寺显如也遵从和议的內容，率本愿寺教团尽数退出石山御坊。
    至此，石山御坊自一向宗中兴之主本愿寺莲如以来作为一向宗总本山仅持续了二十六年的时间。
    虽说近畿诸国的形势已经不利於石山本愿寺，但也还没有到完全失败的地步。
    单单石山本愿寺之中的信徒、坊官、代官、僧兵等就达到了四万余眾，播磨、纪伊、河內、和泉等国仍由一向一揆眾与上杉家为敌。
    加上上杉家並没有完全掌控瀨户內海的制海权，使得石山本愿寺仍然能通过海路源源不断的获得粮草輜重。
    上杉清定鑑於前任一向宗法主本愿寺证如曾经多次出面斡旋调停，使得上杉家得以顺利静謐佐渡、越中、飞驒等国，他本人並不希望以武力去征服石山本愿寺，更不希望与石山本愿寺之间爆发长期的战事，所以只能选择议和並停止战事。
    在清定看来，若是上杉家与石山本愿寺之间的战事陷入持久战、拉锯战，那么到最后只会让毛利家、大友家等尚未降服於上杉家军门之下的西国、九州等地大名进一步壮大。
    再加上，上杉家若想真的攻灭石山本愿寺，必然需要付出大量的人力、物力，且还会对经济发达、人口稠密的摄津湾周边地区造成极大的破坏。
    为了儘可能避免这些经济发达、人口稠密的地区遭到战火波及，以及避免毛利家、大友家等敌对势力坐大，清定自然是希望能儘快结束近畿诸国的战事。
    而且，朝廷方面也完全按照清定的策略、意图去行动，以“赦免”来偷换概念，等於承认了上杉家的正当性，而將与之敌对的石山本愿寺置於不义之地。
    另一方面，对石山本愿寺来说，他们不是遵从上杉家的命令，而是在正亲町天皇的敕命之下进行停战议和。这就让扶桑各地的一向宗信徒、坊官、代官、僧兵等，尤其是曾以生命与上杉家相搏之人也比较好接受。劝说一向宗信徒听从世俗权力的支配，提倡莲如上人以来的“王法为本”。
    才亲政不久的本愿寺显如考虑到，若是石山本愿寺继续与上杉家对抗下去，恐怕会像加贺、三河、越前、近江等国的一向宗寺院那样遭到上杉军的大肆破却，以开山祖师亲鸞上人尊像为代表的各种宝物都將遭到破坏，以至法流断绝，所以不得不选择议和，避免事態进一步恶化。
    毕竟，石山本愿寺中断与三好家之间的联手，就是因为比叡山延历寺之中放置的开山祖师亲鸞上人木像遭到了三好军的烧討。
    然而，统辖著『播磨六坊』的本德寺住持本德寺教什却公然违背本愿寺显如的『法旨』，反而號召播磨一国的一向宗信徒继续袭扰摄津、丹波、但马、因幡等国的境目地带，拒不接受与上杉家进行停战议和一事。
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    为此，本愿寺显如不得不致信本德寺教什的正室、自己的妹妹显妙，
    要求她儘快说服本德寺教什，不要做无谓抵抗，儘快降服於上杉家的军门之下才能获得寺院存续，否则自首任本德寺住持本德寺空善（本愿寺莲如门弟）以来的心血將会付之东流。
    但是，本德寺教什並没有理会本愿寺显如的一片苦心，反而继续在本德寺之中囤积粮草，做好笼城固守的准备。
    之所以本德寺教什有继续与上杉家对抗的底气，是因为本德寺的本堂就位於英贺三木家本据英贺城的城外，寺內町也与英贺城的城下町连成一片。
    可以说，英贺城与本德寺是互为犄角、唇齿相依。
    得知本德寺教什拒绝接受本愿寺显如颁下的『法旨』后，清定也没有为难已经降服的本愿寺显如、庆寿院镇永尼、如春尼、明觉寺行兴、盛光寺祐心、净照坊明春、法专坊贤胜、下间赖总、下间赖言等石山本愿寺高层，便让本愿寺显如对本德寺教什以及播磨一向一揆眾进行破门处理。
    与此同时，清定在平野七名家在笔头末吉利吉的率领下主动降服后，知晓平野七名家曾打造过海船，就对平野七名家颁下本领安堵状，还將末吉利吉之弟末吉利方收为自己的直臣，负责协助九鬼澄隆、九鬼嘉隆等志摩诸將，为上杉家打造战船、商船。
    就这样，末吉家从此一分为二。原末吉家嫡流一脉的末吉利吉被称之为西末吉家（末吉孙左卫门家），末吉利方这一脉则是被称之为东末吉家（末吉勘兵卫家）。
    就在上杉军接管了石山御坊，以及清定將石山御坊更名为大坂城，以示此地已经易帜后不久，千利休、今井宗久、津田宗及三人作为堺町会合眾豪商的代表便来到了芥川山城外请求登城。同时，他们还带上了一名庞大壮硕的金髮异国之人。
    “小人千入道利休（今井彦右卫门宗久、津田助五郎宗及）参见上杉左府殿，承蒙召见，荣幸之至。”千利休、今井宗久、津田宗及三人在被穴泽善右卫门引至芥川山城本丸的大广间后，就向到了端坐在主位上，且身著藏青色锦织直垂，头戴立乌帽子的上杉清定恭恭敬敬的拜伏下去。
    “平身吧，这位异国之人是？”清定很快就注意到站在千利休、今井宗久、津田宗及三人身后的金髮异国人。
    “启稟上杉左府殿，此人是南蛮的伴天连（意为传教士，是葡萄牙语“padre”一词日语音译的汉字写法）扎比·.布莱克索恩，获知我等前来覲见上杉左府殿后，便强烈要求一同前来。”千利休隨即进行解释。
    “哦？上前一些。”清定顿时来了兴趣，便示意这位名为扎比·.布莱克索恩的传教士靠近自己一些。
    “尊贵的大人，在下是伴天连扎比·.布莱克索恩。”扎比·.布莱克索恩上前两步后就恭恭敬敬的向清定鞠了一躬后说道。
    “伴天连？余曾在东国之时听闻过，前任大树殿许可伴天连於两京传教，此番该不会是让余许可伴天连继续在两京传教吧？”清定对传教士並没有什么太大的好感，毕竟传教士没少卖给大友家铁炮、火药甚至是佛郎机炮。
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